玉米锈病主要在7—9月份雨季发病。高温多湿、多雨、多雾季节常易引起病害流行；种植密度大，通风透光差，地势低洼地，偏施、多施氮肥的田块发病严重。
玉米锈病主要危害叶片，也可侵染叶鞘、苞叶和雄穗，其中，普通锈病在叶片上常产生长条状、略突出叶片表面的孢子堆，叶片表皮破裂后，散出褐色的粉末。南方锈病发病时，在叶片上散生黄色小斑点，病斑逐渐隆起，呈圆形或椭圆形，黄褐色或红褐色。植株生长后期，两种锈病都会在病斑上逐渐形成黑色突起，破裂后散出黑色粉状物，为病菌冬孢子。玉米锈病发生造成植株叶片褪绿、不能正常进行光合作用。严重时，叶片上布满孢子堆，叶片干枯，植株提早衰老死亡。
用药防治玉米锈病，应早防早治，力求在零星发病时及时防治。在发病初期喷施25％三唑酮可湿性粉剂1500～2000倍液，或25％丙环唑乳油3000倍液，或12.5％烯唑醇可湿性粉剂4000～5000倍液，10天左右一次，连续防治2～3次，控制病害扩展。选用抗耐病品种，加强田间管理，增施磷钾肥，清除田间病残体集中深埋或烧毁，雨后注意排渍降湿，有利于减轻病害发生。