一是选择质量好的包装。冬天化肥最好还是放在室内仓库里面，不要露天放置，下雪风吹，低温上冻，袋子很容易损坏。一般应该选择两层包装，外包装的膜上贴一层薄的塑料膜，以增强密封性。
二是防止火灾。像尿素、硝酸铵、硝酸钾之类的肥料有助燃性，所以储存的时候要和煤油、汽油、木屑、秸秆这些东西分开来保存。
三是勿用金属撞击。硝酸铵、硝酸钾和铜、铁等金属混在一起很容易爆炸，所以如果产生结块，千万不能用金属像锤或铁锹撞击。
四是别和种子放一起。最值得注意的就是过磷酸钙（即普钙），含有游离酸，若和种子储存在一起，会对种子萌发有影响。
五是分类储存。化肥有酸性和碱性之分，储存的时候应该按种类分开保存，防止挥发影响肥效。